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基于中麻黄萌发种子转录组的黄酮类化合物合成途径基因的挖掘

2014-12-15分类号:Q943.2

【作者】邓楠  史胜青  常二梅  刘建锋  兰倩  江泽平  
【部门】中国林业科学研究院林业研究所  
【摘要】应用新一代高通量测序技术(Illumina Solexa),对中麻黄(Ephedra intermedin)同萌期的种子进行转录组测序,数据重头(denovo)组装后,共获得52 007条Unigene序列,总长为25 043 596 bp。COG功能注释、GO分类及KEGG代谢通路分析后,获得了64 751个GO功能注释,17 701个COG功能注释以及16 942个KEGG注释,并从KEGG通路中找到参与黄酮类化合物合成途径的关键基因片段283个,其中包含了查尔酮合酶基因、细胞色素相关基因和花青素还原酶等基因。中麻黄转录组测序工作的完成,极大地扩充了麻黄的基因资源,为麻黄属植物分子系统进化...
【关键词】中麻黄  转录组  黄酮类化合物  高通量测序
【基金】中央级公益性科研院所基本科研业务费专项资金(RIF2010-10); 林木遗传育种国家重点实验室专项课题(TGB2013012)
【所属期刊栏目】林业科学研究
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