【摘要】科研事业已成为高等学校内涵发展的重要支柱,但是新的高校会计制度对科研经费的账务处理不明确,甚至有歧义,这会严重影响到科研经费的管理,对科研事业发展产生不利影响。同时,关于科研经费的企业所得税纳税义务,征缴双方尚存争议,文章拟对上述问题进行探讨。