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缢蛏丝氨酸蛋白酶基因的序列特征及其表达分析

2013-07-15分类号:S917.4

【作者】金凯  牛东红  王劦  李家乐  
【部门】上海海洋大学农业部水产种质资源重点实验室  上海海洋大学上海市高校水产养殖学E-研究院  
【摘要】含有clip结构域的丝氨酸蛋白酶是一类新的丝氨酸蛋白酶家族,可能参与非特异性免疫防御功能。从缢蛏(Sinonovacula constricta)cDNA文库中筛选出一条丝氨酸蛋白酶同源EST序列,然后通过5'RACE扩增、测序,拼接得到全长为1 228 bp的cDNA序列,包括66 bp的5'非翻译区和160 bp的3'非翻译区,以及1 002 bp的开放阅读框。阅读框共编码333个氨基酸,含有17个氨基酸的信号肽序列,并含有发卡结构域(clip domain)和胰蛋白酶样丝氨酸蛋白酶结构域(Tryp_SPc domain)。在clip结构域中包含6个半胱氨酸残基形成的3个二硫键,在Tryp...
【关键词】缢蛏  丝氨酸蛋白酶  序列分析  基因表达
【基金】国家高技术研究发展计划项目(2012AA10A400-3); 国家自然科学基金(31101897); 上海知识服务平台项目(ZF1206)
【所属期刊栏目】上海海洋大学学报
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