泥蚶34个EST-SSR标记的开发及在格粗饰蚶中的通用性检测
2013-01-15分类号：S917.4
【部门】浙江万里学院浙江省水产种质资源高效利用技术研究重点实验 浙江省海洋水产养殖研究所
【摘要】利用泥蚶转录组高通量测序、拼接获得的大量EST序列开发SSR标记,在1 123条EST序列里筛查到73条含有SSR位点的EST序列,其中54个位点适合设计引物,在位点两侧设计引物并进行PCR扩增。结果显示,46对引物获得稳定扩增的位点,引物在泥蚶奉化群体的多态性检测中发现,有34对引物表现出多态性,共扩增出122个等位基因,各位点的等位基因数Na为2～7个,平均每个位点产生3.59个等位基因,观测杂合度Ho、期望杂合度He、多态信息含量PIC范围分别为0.000～0.600、0.078～0.771、0.106～0.718;Hardy-Weinberg平衡检测显示,13个位点偏离了平衡状态;用N...
【关键词】泥蚶 EST-SSR 多态性 通用性 格粗饰蚶
【基金】国家现代贝类产业技术体系项目(CARS-48); 国家“八六三”高技术研究发展计划(2012AA10A410); 浙江省海洋生物技术产业科技创新团队项目(2012R10029); 宁波市农业择优委托项目(2010C10011)
【所属期刊栏目】水产学报
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