脊尾白虾血细胞全长cDNA文库的构建及EST序列分析
2013-03-15分类号:S917.4
【部门】上海海洋大学水产与生命学院 中国水产科学研究院黄海水产研究所
【摘要】采用SMART技术(Switching Mechanism At 5′end of RNA Transcript)构建了脊尾白虾(Exopalaemon carini-cauda)血细胞全长cDNA文库。结果表明:cDNA初级文库滴度为2.8×106pfu/mL,重组率达99%以上,插入片段在400~2 000 bp;扩增文库滴度为4.3×109pfu/mL。随机挑取100个单克隆进行测序,得到95条平均长度为493 bp的高质量EST序列,序列拼接获得70条unigenes,包括11条contigs和59条singlets。Blast同源比对发现,其中20条unigenes与数据库中已知基因...
【关键词】脊尾白虾 血细胞 cDNA文库 EST 序列分析
【基金】国家863计划资助项目(2012AA10A409); 国家虾产业技术体系项目(CARS-47); 公益性行业(农业)科研专项(201103034); 中央级公益性科研院所基本科研业务费资助项目(20603022012021)
【所属期刊栏目】中国水产科学
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