黄喉拟水龟巨噬细胞炎症蛋白-3α基因的序列特征与组织表达
2013-07-19分类号:S917.4
【部门】中国水产科学研究院珠江水产研究所/农业部热带亚热带水产种质资源利用与养殖重点实验室 上海海洋大学水产与生命学院
【摘要】利用已构建的黄喉拟水龟(Ma)SMART全长cDNA文库,筛选得到巨噬细胞炎症蛋白-3α(MIP-3α)全长cDNA序列,通过设计引物、克隆测序验证,采用相关软件对基因的结构与功能进行预测,并利用实时荧光定量PCR对MaCCL20组织表达特征进行分析。序列结构分析结果表明,MaCCL20 cDNA全长2 318 bp,开放阅读框为261 bp,共编码86个氨基酸,其蛋白为疏水性,不存在跨膜结构。同源性分析表明,黄喉拟水龟CCL20与变色蜥(Anolis carolinensis)亲缘关系最近,与原鸡(Gallus gallus)其次,与哺乳动物的同源性很低;荧光定量PCR结果表明,MaCCL2...
【关键词】黄喉拟水龟 巨噬细胞炎症蛋白-3α cDNA文库 序列分析 组织表达
【基金】国家农业科技成果转化资金项目(2011GB23260021); 中国水产科学研究院院级基本科研业务费专项(2012A0403); 广州市珠江科技新星专项(2012089)
【所属期刊栏目】华中农业大学学报
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