凡纳滨对虾肌钙蛋白Ⅰ型基因4种不同剪切体的序列分析
2013-11-15分类号:S917.4
【部门】广西壮族自治区水产科学研究院广西水产遗传育种与健康养殖重点实验室
【摘要】采用RT-PCR技术克隆了凡纳滨对虾肌钙蛋白Ⅰ基因全长编码序列,对其核苷酸序列和编码的氨基酸序列进行了生物信息学分析,并在对虾肌钙蛋白Ⅰ基因的编码区查找了单核苷酸多态性位点。结果显示:本研究克隆获得了凡纳滨对虾肌钙蛋白Ⅰ基因的4个可变剪切体,其编码的蛋白质均具有Troponin超家族结构域特征,同源性比对发现该蛋白的氨基酸序列在节肢动物中高度保守。系统进化分析发现凡纳滨对虾Tn-Ⅰ3和Tn-Ⅰ4与中国对虾和小龙虾的Tn-Ⅰ遗传距离较近,而Tn-Ⅰ1和Tn-Ⅰ2单独聚为一支,且与其他物种Tn-Ⅰ遗传距离较远;通过测序比较不同个体凡纳滨对虾Tn-Ⅰ基因序列发现在Tn-Ⅰ的4种不同剪切体编码区共同序...
【关键词】凡纳滨对虾 肌钙蛋白Ⅰ基因 剪切体 单核苷酸多态性
【基金】广西自然科学基金项目(2012GXNSFDA053015); 现代农业产业技术体系建设专项(CARS-47)
【所属期刊栏目】上海海洋大学学报
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