凡纳滨对虾COPE基因序列及低温表达分析
2013-02-28分类号:S917.4
【部门】广西壮族自治区水产研究所广西水产遗传育种与健康养殖重点实验室
【摘要】通过对已知耐寒候选基因-COPE基因的克隆和研究,为凡纳滨对虾耐寒性状的分子机理研究提供依据。运用同源克隆和RACE-PCR技术获得凡纳滨对虾COPE基因(LvCOPE)全长cDNA序列,对其进行了生物信息学分析,采用荧光定量PCR研究了LvCOPE基因的组织表达谱及其在低温胁迫下表达量的变化。结果显示,LvCOPE cDNA全长1217 bp,包含888 bp开放阅读框,编码296个氨基酸残基,具有保守的TPR结构域。各物种COPE蛋白序列构建的系统进化树能准确反映各物种间的进化关系。Lv-COPE mRNA在各组织中呈遍在表达,在肌肉组织中表达量最高。低温表达谱分析显示,LvCOPE mR...
【关键词】凡纳滨对虾 COPE基因 基因表达 低温 荧光定量PCR
【基金】广西壮族自治区直属公益性科研院所基本科研业务费(2060302 GXIF-2010-04); 现代农业产业技术体系建设专项资金(CARS-47)
【所属期刊栏目】西南农业学报
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