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凡纳滨对虾3个sHSP成员的序列与表达特征分析

2013-10-28分类号:S917.4

【作者】彭金霞  赵永贞  韦嫔媛  蒋伟明  李咏梅  陈秀荔  殷勤  陈晓汉  
【部门】广西壮族自治区水产研究所  广西水产遗传育种与健康养殖重点实验室  
【摘要】通过搜索凡纳滨对虾EST数据库,获得3个包含完整开放阅读框的sHSP cDNA序列。对3个sHSP cDNA和相应蛋白序列进行多序列比对发现,3个sHSP的cDNA序列同源性非常高,均达到95%以上,但在开放阅读框第376 bp之后,3个基因间有多个插入和缺失突变,使编码的蛋白序列在C端有较大差异,sHSP-1与sHSP-2、sHSP-3蛋白的同源性只有86.5%和78.7%。不同物种多个sHSP蛋白序列构建的系统进化树显示,3个sHSP与其他物种的HSP20.6、HSP21.4和HSP Beta亲缘关系都很近,推测不同物种sHSP起源相似,且同一物种的不同sHSP通过基因复制产生。运用荧光定...
【关键词】凡纳滨对虾  EST库  低温胁迫
【基金】现代农业产业技术体系建设专项(CARS-47); 广西自然科学基金项目(2011GXNSFD018020); 广西科学研究与技术开发计划项目(桂科合1140010-17)
【所属期刊栏目】西南农业学报
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