藏羊VEGF-A基因编码区多态性及生物信息学分析
2013-12-28分类号:S826
【部门】甘肃农业大学动物医学院 中国农业科学院兰州畜牧与兽药研究所
【摘要】为研究藏羊VEGF-A基因编码区多态性与藏羊耐高寒、缺氧环境的相关性,以藏羊的血样为材料,运用DNA池测序和直接测序法检测VEGF-A基因的序列变异,比较其基因型频率和等位基因频率的差异,并对不同的多态位点间进行连锁不平衡和单倍型分析。然后预测蛋白质序列的改变,并用生物信息学软件对蛋白质序列的结构及性质进行分析。结果表明,在藏羊VEGF-A的编码区中有3个多态性位点,SNP2(g.15020T/A)碱基的突变导致了半胱氨酸变为丝氨酸。此氨基酸的变化并没有引起基因所编码蛋白的二级结构的变化。二级结构主要以无规则卷曲和α螺旋为主。SNP1(g.15005T/A)的基因型频率和等位基因频率在藏羊群体...
【关键词】藏羊 VEGF-A基因 多态性 生物信息学分析
【基金】国家绒毛用羊产业技术体系建设专项资金(Nyeytx-40-2)
【所属期刊栏目】华北农学报
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