普通油茶泛素结合酶UBE2-J2的cDNA序列及蛋白质结构分析
2013-12-15分类号：S794.4
【部门】中国林业科学研究院亚热带林业研究所 浙江省金华市东方红林场
【摘要】泛素结合酶(E2)是泛素/26S蛋白酶体途径中3个关键酶之一,在靶蛋白识别、与泛素连接酶(E3)互作等蛋白的泛素依赖性水解和N-末端规则依赖性水解途径的关键环节中起重要作用。采用Solexa测序技术获得了1条普通油茶E2的全长cDNA序列,命名为UBE2-J2,该基因编码239AA,与其它物种的E2具有较高的一致性和相似性;同源建模的结果表明:普通油茶UBE2-J2蛋白具有泛素结合酶催化位点(UBCc),第8 122位氨基酸碱基为其泛素结合酶基因家族的保守区域,第75 122位氨基酸残基区域中有17个可与泛素形成硫酯键中间产物的残基,其中,87位的半胱氨酸残基是该酶活性中心位点,另有5个残基是...
【关键词】普通油茶 泛素结合酶 Solexa测序 生物信息学
【基金】国家林业公益性行业科研专项“林改后南方林地可持续高效经营关键技术研究与集成示范”(201004008); 中央级公益性科研院所基本科研业务费专项资金项目“油茶品种分子鉴别系统构建及油茶基因芯片开发”(RISF6804)
【所属期刊栏目】林业科学研究
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