基于环介导等温扩增技术检测橡树疫霉菌
2013-04-10分类号:S763
【部门】南京农业大学植物保护学院卵菌与真菌分子生物学实验室
【摘要】应用环介导等温核酸扩增技术(loop-mediated isothermal amplification,LAMP)建立了基于颜色判定的简单、快速和灵敏的橡树疫霉菌(Phytophthora ramorum)检测方法。以ITS为靶序列对橡树疫霉菌的分子检测存在无法区分近似种的问题,笔者在橡树疫霉菌的基因组研究中,发现了PrA3aPro类转座子序列。生物信息学分析表明,该序列非常适合作为大豆疫霉分子检测的靶标。利用LAMP技术,以PrA3aPro为靶序列,设计LAMP特异性引物,建立LAMP反应体系与条件,并进行灵敏度和特异性试验。结果表明:整个检测过程仅需1 h,即可通过肉眼直接目测试验结果。...
【关键词】橡树疫霉菌 环介导等温扩增 PrA3aPro 羟基萘酚蓝(HNB)
【基金】国家公益性行业(农业)科研专项(200903004); 国家863计划项目(2012AA101501); 农业部948项目(2010-C17)
【所属期刊栏目】南京农业大学学报
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