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矮牵牛Ty1-copia类逆转座子逆转录酶序列的克隆与分析

2013-08-28分类号:S681.6

【作者】魏跃  颜志明  吴志明  江彪  张蜀宁  
【部门】江苏农林职业技术学院  南京农业大学  南方蔬菜遗传改良重点开放实验室  
【摘要】采用植物Ty1-copia类逆转座子逆转录酶的保守区设计简并引物,经PCR扩增从矮牵牛(Petunia hybrida Vilm.)中扩增出260 bp左右的目标条带,扩增产物经测序及序列分析,总共获得了24条逆转录酶序列。结果表明,24条逆转录酶序列长度变化范围为260~272 bp,同源性范围为49.8%~97%,经核苷酸聚类分析分为7个家族。Ty1-copia类逆转录酶在序列长度、碱基组成上具有高度异质性,翻译成氨基酸后,有18条序列是完整的,另外6条序列出现终止密码子突变或移框突变,终止密码子突变和移框突变是矮牵牛Ty1-copia类逆转座子高度异质性的重要表现。与已登陆的不同植物物种...
【关键词】矮牵牛  Ty1-copia类逆转座子  异质性  同源性
【基金】江苏省自然科学基金项目(SBK20082174); 江苏省三项工程项目(SXGC(2012)373)
【所属期刊栏目】西南农业学报
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