文蛤30个微卫星标记的开发及在斧文蛤和帘文蛤中的通用性检测
2013-08-15分类号：S917.4
【部门】宁波大学海洋学院 浙江万里学院浙江省水产种质资源高效利用技术研究重点实验室 上海海洋大学水产与生命学院
【摘要】为开展文蛤多态性微卫星标记及其在斧文蛤和帘文蛤中的通用性研究,实验从磁珠富集法构建的基因组文库和EST文库中开发了30个文蛤多态性微卫星标记,包括8个G-SSR和22个EST-SSR多态性位点。共获得140个等位基因,平均等位基因数为4.67;多态性信息含量、观测杂合度、期望杂合度分别为0.172～0.744、0.040～0.720、0.187～0.793;G-SSRs的平均等位基因数、平均多态性信息含量、平均观测杂合度和平均期望杂合度都较EST-SSRs高;Hardy-Weinberg平衡检测发现,24个位点偏离了平衡状态;利用BLASTx对含多态性SSR位点的EST进行功能注释,11个位点...
【关键词】文蛤 G-SSRs EST-SSRs 多态性 通用性
【基金】国家自然科学基金项目(30972255); 国家现代贝类产业技术体系项目(CARS-48); 浙江省自然科学基金(Y3110080); 宁波市科技创新团队项目(2011B82017)
【所属期刊栏目】水产学报
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