三疣梭子蟹Ⅰ型微卫星标记的发掘及多态性分析
2013-06-15分类号:S917.4
【部门】中国水产科学研究院黄海水产研究所 上海海洋大学水产与生命学院
【摘要】为发掘三疣梭子蟹Ⅰ型微卫星标记,实验运用生物信息学方法,从NCBI数据库已公开的13 985条三疣梭子蟹EST序列中搜索微卫星位点。结果显示,共搜索到287个微卫星位点,其中主要为二核苷酸重复序列(173个),占总数的60.3%;其次为三核苷酸重复序列(79个),占总数的27.5%;四、五、六核苷酸重复位点较少;在二核苷酸重复位点中,AC/GT重复位点最为丰富,占二核苷酸重复位点总数的53.8%,AG/CT重复次之,占二核苷酸重复位点总数的37.0%,AT和GC重复较少。挑选14个Ⅰ型微卫星标记在野生三疣梭子蟹群体中进行多态性检测,发现8个位点呈多态性,平均多态信息含量(PIC)和平均遗传杂合...
【关键词】三疣梭子蟹 微卫星标记 多态信息含量
【基金】国家“八六三”高技术研究发展计划(2012AA10A409); 中国博士后科学基金(2013M531657); 黄海水产研究所基本科研业务费专项(20603022013039)
【所属期刊栏目】水产学报
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