日本文昌鱼ZP蛋白氨基酸序列多样性的初步研究
2013-07-15分类号:S917.4
【部门】上海海洋大学海洋科学学院 上海海洋大学大洋渔业资源可持续开发省部共建教育部重点实验室 农业部大洋渔业资源环境科学观测实验站 国家远洋渔业工程技术研究中心
【摘要】ZP蛋白家族是一类具有相对保守的ZP结构域的蛋白质,通常在精卵结合过程中起作用。从日本文昌鱼(Branchiostoma japonicum)中发现一种编码927个氨基酸残基的ZP蛋白cDNA。利用SMART预测该ZP蛋白序列含有3个结构域:透明带结构域、跨膜结构域以及低复杂度区域。利用该ZP基因的整个开放阅读框,检测该基因在日本文昌鱼群体中的氨基酸序列多样性。研究结果发现,在9个日本文昌鱼个体中扩增获得序列长度为2 481~2 784 bp,编码826~927个氨基酸。氨基酸序列比对显示,存在55个变异位点,占总氨基酸残基数的5.93%(55/927),其中有2个个体的氨基酸序列分别存在9个...
【关键词】日本文昌鱼 ZP蛋白 ZP结构域 序列多样性
【基金】国家海洋863计划项目(2008AA092602)
【所属期刊栏目】上海海洋大学学报
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