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基于中国明对虾不同组织EST数据的基因表达差异分析

2013-05-15分类号:S917.4

【作者】隗健凯  柳承璋  张晓军  王兵  董波  李富花  相建海  
【部门】中国科学院海洋研究所实验海洋生物学重点实验室  中国科学院大学  
【摘要】对前期获得的中国明对虾头胸部、血液、眼柄、卵巢4种组织的EST测序数据进行了生物信息学挖掘和分析。4种组织的原始EST序列分别为10 446条、2 690条、1 067条和1 282条,通过聚类拼接得到unigene 3 454条、1 053条、406条和544条,对其进行了NR、GO、KEGG等数据库的功能注释,并在此基础上进行了组织差异分析。通过同源比对的方法找出了各组织特异的转录本,并根据注释信息将其进行了GO功能分类。结果显示,血液组在细胞杀伤、迁移和节律等功能分类上特异性富集;眼柄组在色素生成、信号传递和生物学调控等功能分类上特异性富集;卵巢组在营养贮存运输、繁殖和定位等功能分类上特...
【关键词】中国明对虾  表达序列标签(EST)  组织差异  组织高表达基因
【基金】国家“八六三”高技术研究发展计划(2012AA10A404,2012AA092205); 国家自然科学基金项目(30972245,41076101,31172396)
【所属期刊栏目】水产学报
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