大叶藻EST-SSR标记开发及其在大叶藻群体遗传多样性研究中的应用
2013-08-15分类号:S917.3
【部门】农业部海洋渔业可持续发展重点实验室 中国水产科学研究院黄海水产研究所 上海海洋大学水产与生命学院
【摘要】本研究从NCBI的EST数据库中下载大叶藻EST序列共计10 659条,从中得到SSR位点共65个,SSR发生频率为1.7%,平均分布距离为21.7kb。其中三核苷酸为优势重复类型,占49.2%,二核苷酸数量仅次于三核苷酸,占33.8%。基于65条含有SSR的EST序列,设计并合成了30对引物,其中26对引物的扩增产物单一,片段大小与预测的相近或较大。在由16个大叶藻个体组成的群体中,其中8对引物的扩增条带具有多态性。利用这8对引物对青岛汇泉湾大叶藻自然群体进行了遗传多样性分析,结果表明,8个SSR共检测出33个等位基因,平均每个SSR能检测出4.1个等位基因,多个遗传多样性参数表明,青岛汇泉...
【关键词】大叶藻 EST SSR 遗传多样性
【基金】国家公益性行业(农业)科研专项(201003068)资助
【所属期刊栏目】渔业科学进展
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