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苏钟猪FTO基因的mRNA表达、克隆测序及其生物信息学分析

2013-02-28分类号:S828

【作者】付言峰  李兰  王学敏  李碧侠  方晓敏  赵芳  任守文  
【部门】江苏省农业科学院畜牧研究所  中国农业大学动物医学院  国家兽用生物制品工程技术研究中心  
【摘要】脂肪肥胖相关基因(FTO)在控制食欲和能量消耗方面具有重要作用。为进一步了解猪FTO基因的结构和功能,以苏钟猪为试验对象,利用RT-PCR方法,分析该基因在苏钟猪5种不同组织(肺脏、肝脏、心脏、背膘和背最长肌)RNA水平的表达谱信息;对苏钟猪FTO基因的编码序列(CDS)进行了克隆测序,并用生物信息学方法分析了苏钟猪FTO蛋白的结构和不同物种间的同源性。结果表明,FTO基因在苏钟猪各组织中的mRNA表达丰度表现为:背膘>心脏>肺脏>肝脏>背最长肌,其中背膘中的表达量显著高于其他组织(P<0.05)。苏钟猪FTO的CDS区发现了8个SNPs,分别为G52A、C523T、G628A、A655G、A...
【关键词】苏钟猪  脂肪肥胖相关基因  克隆测序  遗传变异  生物信息学
【基金】国家自然科学基金(31201767); 江苏省博士后科研资助计划经费; 江苏省农业科学院博士后基金(No.026056511104); 国家生猪现代产业技术体系南京综合试验站(nycytx-009)
【所属期刊栏目】华北农学报
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