葡萄谱系特有基因生物信息学识别、基因结构与表达特性分析
2013-11-30分类号:S663.1
【部门】南京农业大学园艺学院 吉林省农业科学院果树研究所
【摘要】以葡萄全基因组29 971蛋白序列为查询序列,与包括葡萄在内的31个已测序植物蛋白序列、TIGR和NCBI数据库中的EST和非冗余蛋白质序列进行非同源性比对分析,保留E值大于0.01的序列,去除重复序列、转座子和注释不准确的基因序列,保留的非同源基因识别为葡萄谱系特有基因;并对谱系特有基因的结构和具有芯片表达信息的谱系特有基因的表达特性进行了分析。结果表明:共识别了2 009个葡萄谱系特有基因,与葡萄保守基因相比较,葡萄谱系特有基因平均外显子数量较少,为2个;平均外显子长度较短,为232 bp;平均内含子长度较长,为1 723 bp,与拟南芥、水稻等谱系特有基因结构特点相似,谱系特有基因可能具...
【关键词】葡萄 谱系特有基因 生物信息学 基因表达
【基金】农业部948项目(2011-G21)
【所属期刊栏目】南京农业大学学报
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