葡萄DELLA家族成员VvRGA和VvRGL1的预测、验证及生物信息学分析
2013-04-26分类号:S663.1
【部门】南京农业大学园艺学院
【摘要】利用生物信息学工具,将拟南芥DELLA相关基因序列作为靶序列,在葡萄基因组序列预测出2条DELLA相关基因(序列号为GSVIVT00030538001和GSVIVT00032990001),并进行克隆测序验证和生物信息学分析。经比对发现,它们分别与拟南芥RGA和RGL1相似度较高,为63.59%和51.28%,故分别将其命名为VvRGA和VvRGL1,并进一步对其氨基酸组成成分、理化性质及二级和三级结构进行初步分析。结果表明:VvRGA和VvRGL1均具有保守的GRAS结构域和DELLA结构域;它们与拟南芥相关基因在氨基酸数目和氨基酸序列间的疏水性很相似,但存在一定的差异;两者的二级结构都主要...
【关键词】葡萄 VvRGA VvRGL1 基因预测 验证 分析
【基金】江苏省现代园艺科学优势学科建设工程专项
【所属期刊栏目】南京农业大学学报
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