茌梨果实内切-β-1;4-葡聚糖酶基因的克隆及生物信息学分析
2013-06-28分类号:S661.2
【部门】青岛农业大学园林园艺学院
【摘要】以成熟的莱阳茌梨果实为试材,应用同源克隆和RACE方法从茌梨果肉中克隆到内切-β-1,4-葡聚糖酶基因的一个同源基因cDNA的全长序列,命名为PbEG,其碱基长度为1 971 bp,PbEG的开放阅读框编码493个氨基酸,相对分子量为54.596 1 kDa,等电点为9.14;PbEG编码的蛋白属于糖基水解酶第9家族,不含有跨膜区域但在N-端含有一段信号肽。其编码氨基酸同源性分析表明,茌梨PbEG基因与蓖麻EG基因同源性较高,达到84%,其次是豌豆和葡萄。
【关键词】茌梨 内切-β-1 4-葡聚糖酶基因 生物信息学
【基金】国家自然科学基金项目(31201608); 国家现代农业(梨)产业技术体系建设专项(nycytx-29-06); 山东省高等学校科技计划项目(J09LC13); 山东省优秀中青年科学家科研奖励基金项目(BS2010NY009); 青岛农业大学高层次人才启动基金项目(630803); 青岛市科技计划项目(621268)
【所属期刊栏目】华北农学报
文献传递