芹菜中6-磷酸甘露糖还原酶基因的克隆、进化和表达分析
2013-06-14分类号:S636.3
【部门】南京农业大学园艺学院/作物遗传与种质创新国家重点实验室/农业部华东地区园艺作物生物学与种质创制重点实验室
【摘要】以2个芹菜品种‘津南实芹’和‘美国西芹’为试材,采用RT-PCR技术分别获得6-磷酸甘露糖还原酶(M6PR)cDNA序列。序列分析表明:来源于2个芹菜品种的6-磷酸甘露糖还原酶基因核苷酸序列全长均为930 bp,编码309个氨基酸;预测其蛋白质相对分子质量为35×103,pI值为6.38。空间结构分析显示:M6PR蛋白由11个α-螺旋和13条β-延伸主链组成,中间形成1个疏水穴;催化四分体(Asp、Tyr、Lys和His)分布于疏水穴内部,具有催化活性。进化分析显示:芹菜M6PR与卷柏、小立碗藓、云杉等远古物种的醛-酮还原酶(AKR)相似性较高。实时定量PCR表达分析表明:M6PR基因主要在芹...
【关键词】芹菜 6-磷酸甘露糖还原酶 基因克隆 进化 实时定量PCR 基因表达
【基金】教育部新世纪优秀人才支持计划项目(NCET-11-0670); 国家自然科学基金项目(31272175); 江苏高校优势学科建设项目(2011PAPD); 江苏省双创计划项目(2011JSSC)
【所属期刊栏目】南京农业大学学报
文献传递