杜仲MVA途径相关基因的鉴定及荧光定量PCR引物筛选
2013-08-15分类号:S567.19
【部门】中南林业科技大学生命科学与技术学院 南方林业生态应用技术国家工程实验室 中南林业科技大学林学院 经济林育种与栽培国家林业局重点实验室
【摘要】杜仲富含萜类物质,MVA途径是萜类物质合成的重要途径之一。从杜仲果实转录组数据KEGG中杜仲MVA途径共被注释30条Unigene,根据NCBI中的BLAST比较,分别鉴定了乙酰COA酰基转移酶,羟甲基戊二酰辅酶a合成酶,羟甲基戊二酰辅酶a还原酶,甲羟戊酸激酶,磷酸甲羟戊酸激酶,二磷酸甲羟戊酸脱羧酶基因,被注释7条,3条,11条,2条,2条,5条。表达差异分析表明,以上基因中分别为5条,3条,4条,1条,5条为幼果和成熟果实差异表达基因。对差异表达基因序列进行软件设计、引物特异性分析和实验验证,最终筛选出10对适合杜仲MVA途径SYBR GreenI荧光定量PCR的引物,为MVA途径基因表达差...
【关键词】杜仲 萜类合成MVA途径 荧光定量PCR 引物筛选
【基金】林业公益性行业科研专项(201004029)
【所属期刊栏目】中南林业科技大学学报
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