泡桐的microRNAs及其功能预测
2013-11-15分类号:S792.43
【部门】河南农业大学
【摘要】以不同种(品种)泡桐叶片为材料,利用第二代高通量测序技术和生物信息学方法构建泡桐小RNA(sRNA)文库,并对其microRNA(miRNA)靶基因功能进行分析。结果表明:在得到的87 066 707条高质量reads中,能与泡桐转录组完全匹配的有41 399 208条,占高质量序列的47.55%。sRNA长度主要分布在20~25 nt之间,其中,长度为24 nt的数量最多,其次为21 nt的sRNA。鉴定出的44个保守miRNA分属于14个不同miRNA家族,并且不同miRNA家族的miRNA成员数量也存在差异。对鉴定出的27个新miRNA进行靶基因预测及功能分析,结果为阐明miRNAs在泡...
【关键词】泡桐 microRNA 高通量测序 功能分析
【基金】国家自然科学基金项目(30271082,30571496,U1204309); 河南省杰出人才计划项目(122101110700); 郑州市科技创新团队资金项目(121PCXTD515)
【所属期刊栏目】林业科学
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