小麦磷脂酶Dα的基因克隆及其编码序列的生物信息学分析
2013-02-28分类号:S512.1
【部门】天津农学院天津-布里斯托环境变化对农作物影响研究中心 天津农学院基础科学系
【摘要】为获得更多小麦抗逆基因资源,利用RT-PCR方法克隆了磷脂酶D基因(PLD),命名为TaPLDα,并对基因及其蛋白进行了生物信息学分析。结果表明,TaPLDα开放阅读框为2 394 bp,编码812个氨基酸残基,等电点5.30,分子量为92 kDa。序列分析显示,TaPLDα基因编码的氨基酸序列含有N端C2结构域及2个保守的活性中心。预测TaPLDα蛋白是一个亲水性稳定蛋白且定位于细胞质,其二级结构含28.82%的α-螺旋、20.07%的延伸链、6.03%的β-转角和45.07%的不规则卷曲。该蛋白不存在信号肽,无跨膜区。TaPLDα与水稻、玉米和拟南芥的PLDα氨基酸序列之间具有高度的保守性...
【关键词】小麦 磷脂酶Dα 基因克隆 生物信息学
【基金】国家“863”计划项目(2011AA100104); 天津市应用基础与前沿技术研究计划项目(11JCYBJC09100); 国家转基因新品种培育重大专项(2009ZX08009-084B)
【所属期刊栏目】华北农学报
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