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肠道微生物宏基因组文库构建及酯解酶基因筛选

2013-02-15分类号:Q933

【作者】段嘉  程功  胡永飞  李晶  律娜  朱宝利  
【部门】中国科学院微生物研究所/中国科学院病原微生物与免疫学重点实验室  中国科学院研究生院  
【摘要】利用宏基因组学方法,以人肠道微生物样品为原材料,构建了1个约30 000个克隆的fosmid文库。以三丁酸甘油酯为底物,通过功能筛选,获得1个酯解酶阳性克隆。对该阳性克隆构建亚克隆,挑选具有酯解酶活性的阳性亚克隆进行测序分析,最终获得1个肠道微生物来源的酯解酶基因(GenBank登录号:JQ972699)。结果表明,文库克隆的平均插入片段约为40kb,没有重复插入片段克隆。获得的酯解酶基因推演蛋白与Pyramidobacterpiscolens W5455的patatin样磷脂酶同源性最高,氨基酸一致性为95%。生物信息学分析结果表明该基因可能通过Vd型分泌方式进行分泌并发挥功能。本研究是通过...
【关键词】宏基因组学  肠道微生物  patatin样磷脂酶
【基金】国家重点基础研究发展计划(973计划)项目(2009CB522605)
【所属期刊栏目】中国农业大学学报
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