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基于聚类的蛋白质一级结构与三级结构关联研究

2013-06-15分类号:Q51

【作者】闫庆华  陈绮  
【部门】海南大学信息科学技术学院  
【摘要】为了建立蛋白质一级结构与三维结构间的关联规则,以蛋白质数据库PDB为数据源,采用K均值聚类方法对蛋白质二级结构中α-螺旋、β-折叠和无规则卷曲的疏水值、偶极矩、解离常数3种属性值序列进行分析。结果表明:80%的螺旋和85%的beta折叠都表现出了自身应有的规律,说明聚类分析方法在蛋白质三级结构预测研究中的合理性和有效性。
【关键词】蛋白质结构预测  K均值聚类  关联规则
【基金】海南省自然科学基金项目(609003)
【所属期刊栏目】沈阳农业大学学报
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