黄瓜LDC基因克隆及逆境胁迫下的表达分析
2013-04-26分类号：S642.2
【部门】南京农业大学园艺学院/作物遗传与种质创新国家重点实验室 安徽科技学院生命科学学院 美国威斯康星大学园艺系
【摘要】利用RT-PCR技术从耐冷黄瓜品种‘Chipper’中克隆鉴定了1个赖氨酸脱羧酶(LDC)基因的ORF,命名为CsLDC,在GenBank中的登录号为KC202438。该基因ORF全长为645 bp,编码215个氨基酸的肽链,相对分子质量为23 625.2,等电点为5.99。BLASTp发现该蛋白具有赖氨酸脱羧酶保守序列,与毛果杨的同源性最高,进化树分析表明CsLDC与矮牵牛LDC亲缘关系最近;该蛋白无信号肽但存在一个明显跨膜区,并存在多个蛋白质位点;SWISS-MODEL预测该蛋白的3D结构与拟南芥At2G37210基因编码赖氨酸脱羧酶蛋白2a33相似性为88.89%。荧光实时定量PCR检测...
【关键词】黄瓜 赖氨酸脱羧酶(LDC) 基因克隆 生物信息学 基因表达
【基金】国家973计划项目(2009CB119001); 国家自然科学基金重点项目(30830079)
【所属期刊栏目】南京农业大学学报
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