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利用cDNA-AFLP分析内生解淀粉芽胞杆菌Fy11诱导辣椒差异表达基因

2013-06-16分类号:S641.3

【作者】杨瑞先  范晓静  邱思鑫  蔡学清  胡方平  
【部门】福建农林大学植物保护学院  福建省农业科学院作物研究所  
【摘要】【目的】分析内生解淀粉芽胞杆菌(Bacillus amyloliquefaciens)Fy11诱导辣椒(Capsicum annuum)幼苗差异表达基因,了解辣椒与内生芽胞杆菌互作的分子机制。【方法】利用cDNA-AFLP技术,采用256对引物,分析辣椒幼苗接种内生解淀粉芽胞杆菌Fy11后5个时间点的基因表达谱;利用qRT-PCR分析差异基因表达模式,验证cDNA-AFLP表达谱。【结果】256对引物共产生18 620个转录本(TDF),筛选获得353条差异表达条带,占扩增条带总数的1.89%。经克隆、测序分析,最终获得257个差异TDF,聚类分析得到229个独立基因(EST,unigenes...
【关键词】辣椒  内生解淀粉芽胞杆菌  互作  基因表达  cDNA-AFLP  qRT-PCR
【基金】国家自然科学基金项目(30671463); 福建省发改委项目(KY0030060)
【所属期刊栏目】中国农业科学
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