番茄LBD基因家族的全基因组序列鉴定及其进化和表达分析
2013-06-16分类号:S641.2
【部门】山东农业大学园艺科学与工程学院/作物生物学国家重点实验室/国家苹果工程技术研究中心
【摘要】【目的】从番茄全基因组中鉴定LBD基因,并进行基因进化、基因结构、染色体定位以及组织表达和诱导表达分析,为番茄LBD基因的功能研究与利用奠定基础。【方法】利用番茄基因组数据库,通过生物信息学手段,鉴定番茄LBD家族成员;采用MEGA5软件进行系统进化树分析;通过perl程序、MapDRAW及GSDS工具进行基因结构及染色体定位分析;利用已有的番茄芯片数据进行组织表达谱和基因表达响应分析。【结果】系统分析鉴定了46个番茄LBD家族基因,根据基因结构及系统进化分析将其分成class I与class II两类,细分为5个亚家族(Ia、Ib、Ic、Id与II)。基因定位表明,12条染色体中的10条均有...
【关键词】番茄 LBD基因家族 系统进化 基因表达
【基金】国家自然科学基金项目(31171946)
【所属期刊栏目】中国农业科学
文献传递