菊芋SSR-PCR反应体系优化及3个品种的分子鉴别
2013-12-28分类号:S632.9
【部门】青海省农林科学院菊芋研发中心青海省蔬菜遗传与生理重点实验室
【摘要】本研究通过单因子优化试验和L16(45)正交试验设计的方法,对菊芋SSR-PCR反应体系进行优化。结果表明,20μl最佳反应体系:10×PCR扩增缓冲液,2.5 mmol/L Mg2+,0.20 mmol/L dNTPs,0.30μmol/L正反引物,0.2 U Taq DNA聚合酶和50 ng模板DNA。利用该优化体系,从100个SSR引物组合中筛选出12个清晰且多态性高的引物组合对3个品种的菊芋DNA序列进行扩增,得到58个位点,其中多态性位点39个,多态率为67.2%;建立3个菊芋品种分子识别卡,用2对引物组合的6个多态性位点即可将其分开。本研究为后续应用SSR分子标记技术对菊芋进行种质...
【关键词】菊芋 SSR-PCR 优化 引物筛选 分子鉴别
【基金】国家大宗蔬菜产业技术体系西宁综合试验站(CARS-25-G-49); 青海省蔬菜遗传与生理重点实验室创新基金(Sc-zdsys-2011-02)
【所属期刊栏目】西南农业学报
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