灵芝漆酶注释基因Lacc1的生物信息学分析及其Cu~(2+)诱导表达
2013-06-25分类号：S567.31
【部门】湖南省作物种质资源创新与利用重点实验室 湖南农业大学园艺园林学院 国家中医药管理局亚健康干预技术实验室
【摘要】为验证Lacc1基因的功能,揭示灵芝漆酶基因及其启动子结构与其转录表达的内在关系,预测了Lacc1的氨基酸序列结构及灵芝漆酶注释基因Lacc1的上游启动子区域,研究已测序的菌株——灵芝P9在Cu2+诱导条件下漆酶基因Lacc1的表达情况。Protein Blast分析结果表明,Lacc1含有3个铜氧化酶(Cu-oxidase)保守结构域,与Polyporus ciliatus漆酶lcc3-3的相似性最高,为71%,并具有高度保守的漆酶特征序列L1-L4;亚细胞位置和信号肽预测结果表明,Lacc1含有信号肽,且为胞外分泌酶;Lacc1基因上游启动子区域包含1个TATAbox、3个金属响应元件(M...
【关键词】灵芝 漆酶 生物信息学分析 Cu2+诱导表达
【基金】国家“973”项目(2012CB723004); 国家农业科技成果转化项目(2012GB2D200328)
【所属期刊栏目】湖南农业大学学报(自然科学版)
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