木薯耐旱基因CAT的生物信息学预测与分析
2013-12-28分类号：S533
【部门】中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所/农业部木薯种质资源保护与利用重点实验室
【摘要】利用在线提供的生物信息学软件及Pathway Studio软件,以木薯(Manihot esculenta)过氧化氢酶(CAT)为研究对象,与蓖麻、麻风树、橡胶树、常绿大戟、杨树、盐地碱蓬、樟子松、水稻、甘薯、马铃薯10种植物CAT的氨基酸序列进行比较分析,揭示CAT氨基酸结构与耐旱特性的相关性。结果显示,木薯CAT1全长为1782 bp,包含一条长1479 bp的开放读码框,编码492个氨基酸,通过同源性比对发现木薯CAT氨基酸序列与蓖麻、麻风树、橡胶树、常绿大戟、杨树、盐地碱蓬、樟子松、水稻、甘薯、马铃薯的同源性分别为82%、92%、81%、84%、80%、80%、79%、78%、78%、...
【关键词】木薯 生物信息学 耐旱基因 CAT
【基金】国家“973”重点基础性研究项目(2010CB126606); 中央级公益性科研院所基本科研业务费专项(PZS035,PZS062); 国家“863”基金项目(2012AA101204-2)
【所属期刊栏目】西南农业学报
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