水稻与稻瘟病菌不同小种互作的基因差异表达谱分析
2013-12-16分类号：S511
【部门】吉林省农业科学院 中国农业科技东北创新中心 吉林省农业科学院植物保护研究所 农业部东北作物有害生物综合治理重点实验室 吉林省通化市农业科学院 吉林省农业技术推广总站
【摘要】【目的】分析水稻接种稻瘟病菌(Magnaporthe grisea)48 h后亲和互作与非亲和互作反应的基因表达谱,探索水稻对不同稻瘟病菌抗性差异的分子机理。【方法】运用Affymetrix表达谱芯片分析差异表达mRNA;通过分子注释系统平台(MAS 3.0)对差异表达基因进行了基因注释及GO分析;应用实时定量PCR对部分差异表达基因进行验证。【结果】在49 824个转录本中共检测到大约24 000个转录本,Fold change大于2.5的基因共1 028个,其中非亲和互作上调基因460个,下调基因568个。所验证的4个基因的荧光定量PCR结果与芯片结果基本一致。经GO分析差异基因对应蛋白的...
【关键词】稻瘟病 基因表达谱 基因芯片
【基金】吉林省科技厅重大专项(2060901); 吉林省博士后基金(01920)
【所属期刊栏目】中国农业科学
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