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植物基因组上游开放阅读框的挖掘方法及其翻译调控

2013-08-16分类号:Q943.2

【作者】王庭璋  胡望雄  徐建红  薛庆中  
【部门】浙江大学农业与生物技术学院  
【摘要】基因组中约有20%的基因具有上游开放阅读框(upstream open reading frame,uORF),它位于成熟mRNA 5'端非编码区(5'-UTR)。本文简介了uORF同源群的挖掘方法、分类和进化,以及调控下游mORF翻译的研究进展。植物(拟南芥和水稻等)和昆虫(果蝇等)基因组中普遍存在保守肽uORFs,并且在序列多样性方面有相似之处。但它们在平均长度、基因组聚类、与甲基转移酶的关联性上有所不同。植物uORF的长度通常短于昆虫uORF。借助拟南芥和水稻全长cDNA序列比较,不同的uORF同源群对其下游如转录因子,信号转导因子、发育信号分子和翻译起始因子eIF5等编码基因的mORF...
【关键词】上游开放阅读框  翻译调控  进化  转录因子  转录物
【基金】国家重点基础研究发展计划(“973”计划)项目(2010CB126205); 国家自然科学基金项目(31171165)
【所属期刊栏目】中国农业科学
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