【摘要】香港、澳门回归后,国内对香港、澳门高等教育的研究呈增多之势。在世界体系中,澳门、香港属于典型的微型地区。当前,国内对微型国家与地区高等教育关注较少,且很少有研究者将香港与澳门纳入到微型国家与地区这一视角下进行审视。高等教育管治体系是维系高等教育有效运行的重要保障。通过对澳门、香港、马耳他三个微型国家与地区的比较分析,探析其高等教育管治体系是否具有相关独特性。最后籍借香港、马耳他的经验对完善澳门高等教育管治体系提出了些许思考。