【摘要】自主创新离不开政府科技投入政策扶持,如何合理配置政府科技投入资源,促进以企业为主体的自主创新活动,成为目前经济转型升级关注的焦点。文章以2009—2011年深市高新上市企业为例,实证研究了高新企业自主创新投入强度与科技财政投入的关系。研究结果表明:(1)税收优惠政策较政府直接补贴对企业自主创新的促进效率更高;(2)高新企业技术创新主体意识尚未确立,企业自发性研发支出水平总体较低。