基于SSU rDNA和线粒体cox 1序列分析甲藻中不同生态类群的演化规律
2012-07-15分类号：X55
【部门】上海海洋大学水产与生命学院 国家海洋局东海环境监测中心
【摘要】应用SSU rDNA和线粒体cox 1序列研究甲藻(Dinoflagellate)中不同生态类群的演化关系。通过PCR扩增和测序获取4株甲藻SSU rDNA及其线粒体cox 1部分片段,结合GenBank中24株甲藻的相关序列,以Plasmodium falciparum为外群,构建ML树和NJ树,并采用自展支持度评估进化树分支结构,通过计算后验概率评估进化树整体结构,应用1sKH、SH、ELW和2sKH等方法评估两株ML树间的拓扑结构。结果显示,在由上述两序列构建的进化树上,底栖原甲藻均未与浮游原甲藻聚类,且前沟藻具有独特演化地位。表明联合选择SSU rDNA和线粒体cox 1序列构建的进化...
【关键词】浮游型甲藻 底栖型甲藻 利玛原甲藻 强壮前沟藻 SSU rDNA cox1
【基金】上海市优秀学科带头人计划项目(08XD1403700); 上海市科委国际合作项目(08540702600);上海市科委农业重点攻关项目(10391901900); 海洋公益性行业科研专项经费(200905010); 国家海洋局重点实验室开放研究基金资助项目(MATHAB200907)
【所属期刊栏目】中国水产科学
文献传递
