应用DGGE技术分析流清河湾扇贝养殖海区细菌群落结构的季节变化
2012-03-15分类号:S944
【部门】中国海洋大学海水养殖教育部重点实验室 中国水产科学研究院黄海水产研究所
【摘要】细菌是海区生态环境的重要组成部分,为了解扇贝养殖海区细菌群落结构的季节性变化,连续11个月(2009年5月—2010年4月,2月除外)定期采集青岛流清河湾扇贝养殖海区水深0.5 m处水样,过滤收集粒径0.22~3.00μm的微生物,采用CTAB法提取样品总DNA,PCR扩增细菌16S rDNA V3-V5可变区序列,并通过DGGE技术对所得序列进行分离,结果共得到36条不同位置的条带,1月份水样细菌群落条带数最为丰富,3月份水样的细菌群落条带数最少。基于各月份DGGE条带数目和相对光密度,对11个月份样品的细菌群落多样性进行UPGMA聚类分析,结果表明,3、4和5月份细菌群落多样性具有较高的相...
【关键词】细菌群落结构 16S rDNA PCR-DGGE 流清河湾
【基金】现代农业产业技术体系专项资金项目(CARS-48)
【所属期刊栏目】水产学报
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