溶藻弧菌相关分离株的分子及VITEK鉴定
2012-03-15分类号：S941
【部门】宁波大学应用海洋生物技术教育部重点实验室 宁波出入境检验检疫局 浙江省宁波市鄞州区渔业技术管理服务站
【摘要】哈维群弧菌是弧菌属的核心菌群,包括溶藻弧菌在内的6个种在表型和遗传型上均十分相似,要准确鉴定各种有一定难度。看家基因的研究及生化鉴定系统的出现为弧菌鉴定提供了多种方法,本文比较了16S rRNA基因、toxR基因和pyrH基因以及VITEK 2 COMPACT GN鉴定卡对溶藻弧菌相关分离株的分辨力。哈维群弧菌基因组内16S rRNA基因是多拷贝的,且拷贝间序列差异大于种间差异,不适用于种的鉴定。单拷贝基因toxR和pyrH序列种内差异均小于种间差异。基于toxR基因相似性比较可清楚地将18个疑似溶藻弧菌分离株和5个参比株归并到4个种;toxR基因系统发育学分析也显示,哈维群弧菌各种独立地聚类...
【关键词】溶藻弧菌 16S rDNA toxR pyrH VITEK2COMPACT
【基金】国家自然科学基金项目(30970104); 浙江省自然科学基金人才培养项目(R305333); 宁波市科技计划项目(2010C10013); 宁波大学人才工程项目(2010859);宁波大学科研基金(xkl116)
【所属期刊栏目】水产学报
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