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牙鲆肝脏抗菌肽-2基因序列和表达分析

2012-12-28分类号:S917.4

【作者】陈晓武  施志仪  李倩  江山  
【部门】上海海洋大学农业部淡水水产种质资源重点实验室  
【摘要】抗菌肽是鱼类先天免疫的组成部分,发现新的抗菌肽对于动物抗病机理的研究和寻找新药物有重要意义。经过对GenBank数据库中牙鲆EST文库进行同源比对后,筛选得到一个具有完整编码框的抗菌肽cDNA序列,结果再经过RT-PCR进行验证,命名为LEAP-2,对该序列进行注释,获得序列登录号EU586111。该抗菌肽能编码102个氨基酸的多肽,前28个氨基酸组成信号肽。推测编码蛋白质分子量为11 276.9 u,理论等电点(PI)为9.33。其蛋白质序列与另外9种鱼类的同源抗菌肽序列比较发现,同源性介于38.2%~61.7%。其中57至92位氨基酸为高度保守区,是维持其空间结构的主要区域,其中包含有4个...
【关键词】牙鲆  肝抗菌肽2  序列分析  同源建模
【基金】国家自然科学基金项目(31172392); 上海市教委科研创新项目(12YZ126); 上海市自然科学基金(12ZR1412900)
【所属期刊栏目】华北农学报
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