标题
  • 标题
  • 作者
  • 关键词

鳀科鱼类线粒体全基因组序列结构特征及系统发育信息分析

2012-02-15分类号:S917.4

【作者】张丽丽  程起群  
【部门】农业部海洋与河口渔业资源及生态重点开放实验室中国水产科学研究院东海水产研究所  南京农业大学无锡渔业学院  
【摘要】为了解鳀科鱼类的线粒体全基因组序列结构特征及系统发育信息,以期为进化遗传学研究和分子标记的选取提供参考依据,对已知的10种鳀科鱼类的线粒体全基因组进行分析。结果显示:1)鳀科线粒体基因组全序列长度在16 660 bp到17 069 bp之间,基因组的结构和基因排列顺序与其它硬骨鱼类一致。2)比对后获得一致序列长度为15 704 bp(不含D-loop),其中变异位点5 570个,占所有位点数的35.5%。在编码基因中,序列变异程度和Kimura双参数遗传距离最大的是ND6基因(分别是47.5%和0.276),最小的是tRNA拼接序列(分别为18.7%和0.072)。3)基于Ka-Ks的Z检验和...
【关键词】鳀科  线粒体  基因组特征  自然选择  系统进化
【基金】上海市科委创新行动计划项目资助(08391910300)
【所属期刊栏目】海洋渔业
文献传递