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凡纳滨对虾围食膜蛋白基因全长cDNA的克隆及序列分析

2012-10-15分类号:S917.4

【作者】陈秀荔  赵永贞  彭敏  杨春玲  蒋伟明  李咏梅  曾地刚  马宁  黎铭  陈晓汉  吴铁军  
【部门】广西水产研究所广西水产遗传育种与健康养殖重点实验室  
【摘要】为研究凡纳滨对虾围食膜蛋白在IHHNV感染虾体过程中的作用,实验采用SMART技术构建了凡纳滨对虾肠道组织的全长cDNA文库,电子拼接获得了对虾围食膜蛋白基因全长cDNA序列,并进行了功能分析。全长cDNA文库的库容达1.05×106pfu/mL,重组率为95%。随机挑选1 600个克隆进行测序,去除载体后得到插入长度≥450 bp的有效序列1 531条,根据同源片段长度不小于100 bp,90%同源性的原则对这些序列归并unigene,得到unigene 399条。从所测克隆中得到一个围食膜蛋白基因,其cDNA序列长度为1 002 bp,编码由303个氨基酸组成的蛋白,基因序列比对发现该序列...
【关键词】凡纳滨对虾  围食膜蛋白  对虾传染性皮下及造血组织坏死病毒  克隆
【基金】广西科学研究与技术开发计划课题(桂科攻11107012-1-3); 广西自然基金重点项目(2012GXNSFDA053015); 现代农业产业技术体系建设专项(CARS-47)
【所属期刊栏目】水产学报
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