基于PCR-DGGE技术分析生物絮团的细菌群落结构
2012-10-15分类号:S917.1
【部门】中国水产科学研究院珠江水产研究所 农业部热带亚热带水产资源利用与养殖重点实验室 上海海洋大学水产与生命学院
【摘要】在草鱼养殖过程中添加碳源(葡萄糖)维持水体C∶N为20∶1以培养生物絮团,通过对生物絮团细菌群落构成进行种类鉴定来评价生物絮团中功能微生物的组成。采用PCR-DGGE(变性梯度凝胶电泳)技术分析生物絮团形成第5、10和15天的细菌群落结构。DGGE指纹图谱结果分析表明:第5天和第10天的相似性最高,达67.4%;第5天和第15天相似性系数最低仅为40.5%。第10天时微生物多样性最高,第15天时多样性最低。对DGGE指纹图谱特征条带进行回收、克隆测序,结果表明,生物絮团培养过程主要微生物类群隶属于以下6个纲:α-变形菌纲(Alphaproteobacteria)、γ-变形菌纲(Gammapro...
【关键词】生物絮团 细菌群落结构 α-变形菌属 PCR-DGGE
【基金】现代农业产业技术体系建设专项(CARS-46-17); 公益性行业科研专项(201203083); 国家科技支撑计划课题(2012BAD25B04); 广东省海洋渔业科技推广项目(A200901D04)
【所属期刊栏目】水产学报
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