光皮桦茎叶cDNA文库构建及部分EST序列SSR分析
2012-07-15分类号:S792.159
【部门】亚热带森林培育国家重点实验室培育基地 浙江农林大学林业与生物技术学院
【摘要】以光皮桦茎叶组织为材料,构建了cDNA文库。初级文库滴度为1.5×106pfu/mL,重组率达97.3%,插入片段大小在0.5~3.0kb之间,平均长度约为1.3kb,表明所构建的文库质量较高,可用于后续基因克隆及基因表达谱的研究。利用微卫星查找软件对获得的224条EST序列进行微卫星位点搜寻及其丰度、分布比较,发现47条序列含微卫星位点60个,占全部EST序列的26.80%;在所有SSRs中二碱基重复最多,为42个,占总数的70.00%,含三、四碱基重复分别占总数的28.30%和1.70%。通过对光皮桦EST序列中微卫星位点信息的发掘分析,为有针对性地设计EST-SSR引物、进行遗传多样性分...
【关键词】光皮桦 cDNA文库 SSR分析
【基金】浙江省重大科技专项重点项目(2008C02004-1); 浙江省林业科技重点项目(2006SY01)
【所属期刊栏目】北京林业大学学报
文献传递