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毛果杨全基因组磷酸根转运蛋白家族成员序列分析

2012-08-20分类号:S792.11

【作者】王策  秦静静  甘红豪  李红  罗志斌  
【部门】西北农林科技大学生命科学学院  西北农林科技大学植物保护学院  西北农林科技大学林学院  
【摘要】磷酸根转运蛋白是一类主动转运磷酸根的重要载体蛋白。主要探讨毛果杨Populus trichocarpa全基因组中磷酸根转运蛋白(phosphate transporter)家族成员的系统发生和部分成员的理化性质、结构特点及亚细胞定位。以从毛果杨全基因组数据库中搜索并筛选得到的目标蛋白序列为基础,利用相关生物信息学软件对其进行系统发育分析,并利用一系列在线服务器对部分成员的理化参数、亲/疏水性、跨膜域、二级结构、三级结构和亚细胞定位进行了重点分析。结果表明,在毛果杨全基因组中共发现了31个磷酸根转运蛋白家族成员,根据其序列相似性,可分为4个亚家族,即PtrPHT1,PtrPHT2,PtrPHO1...
【关键词】生物化学  磷素  杨树  基因组  序列分析  生物信息
【基金】国家重点基础研究发展计划(“973”计划)项目(2012CB416902); 国家自然科学基金资助项目(31070539); 教育部新世纪优秀人才支持计划资助项目(NCET-08-0468); 教育部高等学校博士学科点专项科研基金资助项目(20090204110027); 霍英东教育基金会资助项目(121026)
【所属期刊栏目】浙江农林大学学报
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