山核桃SSR标记的初步开发
2012-08-20分类号:S664.1
【部门】浙江农林大学亚热带森林培育国家重点实验室培育基地 浙江省龙泉市林业局
【摘要】基于山核桃Carya cathayensis脂肪代谢相关cDNA文库的部分测序结果,发现43条cDNA序列具有简单重复序列(SSR)碱基重复特点,用Primer Premier 5设计了34对表达序列标签-简单重复序列(EST-SSR)引物;建立了适用于山核桃的SSR分析体系,并用设计的SSR引物对对天然群体山核桃40个样品进行了初步的应用性试验。结果表明:34对引物中有4对无扩增产物,3对引物的扩增产物超过了设计范围,27对引物在供试的40个山核桃材料中有较清晰且稳定的目标扩增产物,其中有18对引物的扩增产生了22个多态性位点,占总扩增位点数的47.8%。将SSR标记分析结果与山核桃已有的显...
【关键词】经济林学 EST-SSR 山核桃 cDNA文库
【基金】国家自然科学基金资助项目(30771752); 浙江省自然科学基金资助项目(Y306373); 浙江农林大学研究生科研创新基金资助项目(2112010002)
【所属期刊栏目】浙江农林大学学报
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