葡萄醛脱氢酶(ALDH2)基因进化、表达及启动子功能的生物信息学分析
2012-08-15分类号:S663.1
【部门】西北农林科技大学园艺学院农业部西北地区园艺作物生物学与种质创制重点开放实验室 西北农林科技大学葡萄酒学院陕西省葡萄与葡萄酒工程技术研究中心 西北农林科技大学旱区作物逆境生物学国家重点实验室
【摘要】【目的】研究葡萄醛脱氢酶ALDH2基因家族中ALDH2B4、ALDH2B8和ALDH2B9 3个成员的进化关系,对其在病原菌侵染、非生物胁迫及激素处理下的表达进行分析,为揭示ALDH2基因在植物逆境胁迫下的作用机理提供理论依据。【方法】运用生物信息学方法,鉴定葡萄ALDH蛋白序列;通过葡萄和拟南芥ALDH2基因的系统发育树、基因结构及同线性分析探讨其进化关系;利用葡萄Affymetrix芯片数据,分析葡萄ALDH2(ALDH2B4、ALDH2B8和ALDH2B9)基因在病原菌侵染、非生物胁迫和激素处理下的表达谱;采用在线软件PlantCARE分析3个葡萄ALDH2基因的启动子元件组成差异。【结...
【关键词】葡萄 醛脱氢酶 进化分析 逆境胁迫 表达分析 启动子
【基金】国家自然科学基金项目(30871701,31071782,30671446); 教育部新世纪优秀人才支持计划项目(NCET-07-0702); 2008年杨凌葡萄苗木繁殖基地项目
【所属期刊栏目】西北农林科技大学学报(自然科学版)
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