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草原樱桃PGIP基因的克隆及生物信息学分析

2012-12-28分类号:S662.5

【作者】于文全  刘海荣  杨晓华  赵恒田  
【部门】黑龙江省农业科学院牡丹江分院  中国科学院东北地理与农业生态研究所  
【摘要】为了克隆草原樱桃多聚半乳糖醛酸酶抑制蛋白基因,并进行生物信息学分析。以草原樱桃叶片基因组为模板,PGIP基因保守序列设计引物,通过PCR扩增获得约1 kb的DNA片段。序列分析表明,该基因全长1 193 bp,包含有1个完整的开放阅读框,由2个外显子和1个内含子构成,外显子总长990 bp,编码330个氨基酸,其编码的氨基酸序列中含有一段典型的亮氨酸重复序列,GenBank登录号为GU068977;该基因与中国李、杏、桃、马哈利樱桃、梅等李属植物的PGIP基因序列一致度达95%~99%。系统进化分析显示,属内亲缘关系较近、属间亲缘关系较远的特点。克隆了草原樱桃PGIP基因,为樱桃抗病育种提供一...
【关键词】草原樱桃  PGIP基因  基因克隆  生物信息学
【基金】吉林大学农学部博士启动基金项目(430505010203); 长春市科技局国际合作计划项目(2D5070046202)
【所属期刊栏目】华北农学报
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